普通cygwin上でコンパイルした実行ファイルは，cygwinの肝であるcygwin1.dllを介して実行されるが，MinGWを使えばcygwin1.dllが必要のない実行ファイルが出来る(らしい．詳しくはこちらへ)．
MinGWを使うのは簡単で，cygwinのsetup.exeからMinGWをインストールし(デフォルトで入ってるっぽい．Devel/mingw-runtimeっていうのがそうかな？)，gccのオプションに-mno-cygwinを付けるだけである．ただしgcc -mno-cygwinではインクルードパスリストに/usr/includeは含まれない為，明示的に-I/usr/include等とする必要あり．